Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rfc5Q9D0F6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfc5Q9D0F6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rfc5Q9D0F6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rfc5Q9D0F6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rfc5Q9D0F6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rfc5Q9D0F6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfc5Q9D0F6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms