Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms