Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms