Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shmt2Q9CZN7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms