Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis18aQ9CZJ6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis18aQ9CZJ6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms