Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd8Q9CZG3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Commd8Q9CZG3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Commd8Q9CZG3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd8Q9CZG3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms