Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms