Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms