Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Xrcc3Q9CXE6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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