Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prkrip1Q9CWV6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms