Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms