Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx10Q9CWT3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx10Q9CWT3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms