Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdca4Q9CWM2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdca4Q9CWM2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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