Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms