Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm26657Q9CVR1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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