Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fcf1Q9CTH6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fcf1Q9CTH6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fcf1Q9CTH6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fcf1Q9CTH6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms