Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox16Q9CR63 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox16Q9CR63 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms