Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CR55 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Q9CR55 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CR55 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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