Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms