Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms