Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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