Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms