Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms