Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rpl39lQ9CQD0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl39lQ9CQD0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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