Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med4Q9CQA5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms