Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms