Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms