Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lrrc18Q9CQ07 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc18Q9CQ07 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc18Q9CQ07 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lrrc18Q9CQ07 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lrrc18Q9CQ07 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lrrc18Q9CQ07 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc18Q9CQ07 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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