Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmc1Q9CPZ8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmc1Q9CPZ8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmc1Q9CPZ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmc1Q9CPZ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms