Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg3Q9CPX6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms