Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ssxb1Q9CPU1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ssxb1Q9CPU1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ssxb1Q9CPU1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ssxb1Q9CPU1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb1Q9CPU1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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