Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg3Q99P81 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms