Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms