Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH0

Ankrd17, Ankyrin repeat domain-containing protein 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd17Q99NH0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ankrd17Q99NH0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ankrd17Q99NH0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ankrd17Q99NH0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ankrd17Q99NH0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ankrd17Q99NH0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ankrd17Q99NH0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ankrd17Q99NH0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms