Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NsmfQ99NF2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmfQ99NF2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmfQ99NF2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmfQ99NF2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NsmfQ99NF2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms