Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms