Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brms1Q99N20 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms