Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms