Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd1Q99MV1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms