Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncaipQ99ME3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms