Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms