Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk5rap3Q99LM2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5rap3Q99LM2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5rap3Q99LM2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5rap3Q99LM2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms