Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Sh3bp5lQ99LH9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms