Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lysmd3Q99LE3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms