Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clint1Q99KN9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms