Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lims1Q99JW4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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