Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec3Q99J72 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms