Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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