Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms