Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms